袁真得到消息的时候，又惊又喜。喜的是浚仪城已下，自己北伐的任务已经完成惊的是这群燕兵不知道去了什么地方，是否会带来祸患。袁真当下便派出斥候，沿着浚仪渠向石门方向一路探查，想知道这一路燕军的确切动向。
不管怎样，浚仪城已经拿下，这条运粮的水道算是打通了。袁真赶紧又写了一份战报派信使送给大司马桓温，就说豫州军激战一天，已经攻克浚仪城。慕容德残部出城逃走，粮道已经开通云云。
却说大司马桓温，在枋头被慕容垂所阻，前进不得又听斥候来报，说秦军两万步骑已经到了获嘉县。不止如此，清水入河的粮道已经不通了，而袁真带领的西路军一直没能攻克浚仪。现在已经是九月中，天气渐渐凉了，北方很快就会入冬。晋军将士们都是自江南来，可没有携带冬衣，根本就无法在冬季作战。
桓温深知此次北伐的战机已失，如不尽快撤离，恐怕这些北伐军将士就回不去了。因此在九月十九，桓温焚烧多余的辎重和船只，开始向南撤退，此次北伐宣告失败了。
大军渡过黄河之后，便焚烧了所有的船只，开始沿陆路南下。
燕军主将慕容垂听说桓温已经向南撤退，却没有率兵急追，而是亲自率领了八千骑兵渡河，尾随在后，并四处放出风声，派人在晋军撤退的河和水井里面投毒。桓温听说了之后，恨得牙痒痒，却又不敢拿数万人的性命开玩笑，只好一路走，一路自挖水井。只不过如此一来，晋军撤退的速度太慢，每天不过能走二十来里路而已。
眼见得晋军败走，燕军诸将都要求冲上去跟晋军决战，主将慕容垂却不同意。他说：“现在晋军虽然退走，却并未遭逢大败，因此他们并不会士气低落，不敢与我军交战他们现在刚刚退走，队伍里并不缺乏粮草，这样一支队伍，我们纵然能取胜，也必然损失惨重。何况现在他们并未放松警惕，每日行军不过二三十里，而邓遐作为晋军第一猛将，一直率领军中的精锐在后军断后，这个时候我们不能上去硬碰硬！”
于是燕军只是远远地跟在晋军的后面，等着晋军露出疲态。
苟兴、邓羌等人率两万秦兵到达获嘉县之后，便再也没有行动。这是因为出发之前王猛有交代，若是燕晋交战的双方势均力敌或者是燕军处在上风，就不要出手，让他们互相消耗。若是晋军占了上风，则要尽可能的和燕军联手，把晋军赶回江南去。
秦军到达获嘉县的时候，慕容垂已经率领燕军稳住了阵线，并且取得了几次局部的胜利，还派人不断地骚扰晋军的补给线。燕军丝毫没有露出败象，所以秦军也乐得在旁边看戏。不过，邓羌、苟兴没有料到晋军居然跑得这么快，等他们得知消息的时候，晋军已经全部渡过黄河了。
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