医疗联队分为两部，跟随战斗部队作战的医疗忍者们被打散进每个忍者班跟随作战部队一起行动，这部分医疗忍者的队长是……角都。
角都的地怨虞之术其实具有强大的医疗能力，缝个断胳膊断腿完一样，连脑袋掉了只要角都在一边都能给及时接上，让他客串下医疗忍者，算人尽其用。再说了，总得有人保护脆弱的医疗忍者们不是。
而另一部分医疗忍者则是以八十艘大型空忍战舰为基地所建立战地医院，这部分医疗忍者的队长是德高望重的医疗忍者千代婆婆，千代婆婆的助手是静音，以及负责管理普通人医师的伢子，还有空忍村首领神农，以及一个中队的空忍忍者作为辅助。
原著中只是龙套的空忍村被岩隐兼并掉之后，反而迎来了发展与壮大，空忍的力量在匠忍村的技术和岩隐的财力支持下，实力已远超空忍曾经的全盛时期。
上原大力助力发展空中力量所带来的结果是，空忍建造的大大小小的舰只有一千多艘，战舰比空忍的人数都多了，多到找不到足够的人手来操纵那些空中巨兽。
有大约一百艘加装了厚重装甲以及撞角和查克拉炮，携带了大量航空炸弹的空忍战舰被编成了空中支援联队，主要给忍者联军提供查克拉大炮开路，地毯轰炸，神风冲撞，等等支援。
作战部队被鹿久按照作战职能，划分了近距离作战部队，中距离作战部队，远距离作战部队，支援部队，以及奇袭部队。
第一大队为近距离作战部队，队长为岩隐村的爆遁忍者，狩，副队长为灼遁叶仓，还有黄土。近距离作战部队人数约有十一万人，其中包括忍武者军团全部，以及一万名擅长近身格斗的忍者组成。
第二作战大队为中距离作战部队，忍者数目为一万人，这部分忍者中集中了大量擅长手里剑术的忍者，诸如岩隐风魔一族的忍者，大部分都被编在这里。第二大队队长为旗木卡卡西，各副队长也都是一些很强力的忍者，比如桃地再不斩，砂隐的风遁忍者马基，雾隐的长十郎等等。
远距离作战部队的忍者数目有两万人，数量是作战部队中忍者数量最多的，这是忍者联军中最具有战术性的部队，大规模施展联合忍术将是远距离作战部队的主要攻击方式。岩隐村大型土遁术，加上木叶的大型火遁，或者云隐的大型联合忍术加上雾隐的联合水遁术，诸如此类。
以联合忍术来称呼以村为单位相互配合而施展的忍术已经不太合适了，更确切的称呼，应该是——联军忍术，动辄发动万人以上规模的战略级的联合忍术。
支援部队在战场上主要负责支援中距离和近距离作战的部队，而要及时支援各部，必须要有足够的体力和速度。拥有充沛体力和速度的忍者，几乎都等同于精锐了。所以支援部队强力的忍者很多。
而且，支援部队有一个更重要的任务，联军可能遇到各种拥有特殊能力的忍者，当其他部队遭遇能力特殊的敌人时，支援部队要有解决麻烦能力。所以支援部队也聚集了与绝敌人对等的很多能力特殊的忍者，血继忍者和秘术忍者大多都集中在了支援部队之中。岩隐的血继收集部队水无月组，现存唯一的尸骨脉血继者君麻吕，日向宁次，油女志乃，宇智波佐助，漩涡鸣人，还有上原的学生龙舌和无垢，他们都在支援部队之中。
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